Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trim55G3X8Y1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trim55G3X8Y1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Trim55G3X8Y1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,1 ms