Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XntrpcF8VQM8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XntrpcF8VQM8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XntrpcF8VQM8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms