Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Speer4aF8VPX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Speer4aF8VPX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4aF8VPX6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4aF8VPX6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4aF8VPX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4aF8VPX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4aF8VPX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms