Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LctF8VPT3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LctF8VPT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LctF8VPT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms