Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8334F7CD45 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8334F7CD45 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms