Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28038F7BCN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28038F7BCN9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28038F7BCN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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