Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm340F6RGI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm340F6RGI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm340F6RGI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms