Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf165E9QAU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf165E9QAU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf165E9QAU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms