Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cald1E9QA15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cald1E9QA15 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cald1E9QA15 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cald1E9QA15 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cald1E9QA15 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms