Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7bE9Q9Y3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc7bE9Q9Y3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms