Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Aknad1E9Q8N6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aknad1E9Q8N6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aknad1E9Q8N6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aknad1E9Q8N6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms