Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1iE9Q7P2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1iE9Q7P2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms