Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8882E9Q7E4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8882E9Q7E4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm8882E9Q7E4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8882E9Q7E4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms