Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp31E9Q6Y8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp31E9Q6Y8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp31E9Q6Y8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp31E9Q6Y8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.2 ms