Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Simc1E9Q6E9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Simc1E9Q6E9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms