Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srsf11E9Q6E5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srsf11E9Q6E5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf11E9Q6E5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf11E9Q6E5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms