Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfr2E9Q5M4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfr2E9Q5M4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.7 ms