Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BC005561E9Q5E2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BC005561E9Q5E2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BC005561E9Q5E2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BC005561E9Q5E2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms