Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms