Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tarbp1E9Q368 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tarbp1E9Q368 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tarbp1E9Q368 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tarbp1E9Q368 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms