Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2U8

Gm20721, Predicted gene, 20721, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20721E9Q2U8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20721E9Q2U8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20721E9Q2U8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20721E9Q2U8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms