Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
6430550D23RikE9Q1X6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms