Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc171E9Q1U1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc171E9Q1U1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms