Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp558E9Q1J0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp558E9Q1J0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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