Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm3893E9Q1I1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3893E9Q1I1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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