Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syde2E9PUP1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde2E9PUP1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Syde2E9PUP1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms