Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc78D3Z5T1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc78D3Z5T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc78D3Z5T1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms