Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430403G16RikD3Z5L4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
5430403G16RikD3Z5L4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
5430403G16RikD3Z5L4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms