Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gm20521D3Z5F7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm20521D3Z5F7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gm20521D3Z5F7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gm20521D3Z5F7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gm20521D3Z5F7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gm20521D3Z5F7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gm20521D3Z5F7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gm20521D3Z5F7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gm20521D3Z5F7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms