Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc170D3YXL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc170D3YXL0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc170D3YXL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc170D3YXL0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms