Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samd1D3YXK1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samd1D3YXK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samd1D3YXK1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms