Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl10D3YWW5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl10D3YWW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl10D3YWW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl10D3YWW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl10D3YWW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl10D3YWW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl10D3YWW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl10D3YWW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms