Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo5D3YW29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo5D3YW29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo5D3YW29 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo5D3YW29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo5D3YW29 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rexo5D3YW29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rexo5D3YW29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms