Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30cD3YVI9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30cD3YVI9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30cD3YVI9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30cD3YVI9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms