Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx8D3YU81 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx8D3YU81 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms