Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nxpe3B9EKK6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nxpe3B9EKK6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nxpe3B9EKK6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms