Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmf1B9EKI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmf1B9EKI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmf1B9EKI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmf1B9EKI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms