Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcb5B5X0E4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms