Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnldc1B2RXZ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms