Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia1B2RXQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia1B2RXQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia1B2RXQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms