Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AU015836B2RUM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AU015836B2RUM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AU015836B2RUM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms