Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Brpf1B2RRD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brpf1B2RRD7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brpf1B2RRD7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms