Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1B2KF50 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1978.7 ms