Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a6B1AVK5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a6B1AVK5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a6B1AVK5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms