Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtpruB1AUH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PtpruB1AUH1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtpruB1AUH1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PtpruB1AUH1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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