Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spocd1B1ASB6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spocd1B1ASB6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms