Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp11A9YVJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp11A9YVJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp11A9YVJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms