Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skint3A7TZF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Skint3A7TZF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skint3A7TZF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms