Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2al1jA2BFR3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms