Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lgr4A2ARI4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lgr4A2ARI4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lgr4A2ARI4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms